Lo Slovan fu fondato il 1º aprile 1919 al Café Panonia in Bratislava, come I.ČsŠK Bratislava.
Varie furono le denominazioni assunte di questo club che riuscì ad aggiudicarsi, a livello internazionale, la Coppa delle Coppe mentre a livello nazionale ha trionfato in quindici occasioni nel campionato slovacco e per otto volte nella massima divisione della Cecoslovacchia.
I gagliardetti odierni a partire dall’esemplare in uso nel 1937 per poi passare a quello del 1949 e quindi agli anni Settanta per poi finire nel 2011 sono una piccola antologia di stemmi e colori della gloriosa squadra slovacca.
